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【思路】
第一空,通过前文“在人的脑海里”,说明设空处前的“这一切”代指脑海中的想法和观念等。故所填入的词语要能与观念和想法相搭配。A项“颠覆”,翻倒,可以与“想法和观念”搭配,保留。B项“推倒”否定已有的说法、计划、决定等,可以与“想法和观念”搭配,保留。C项“颠仆”指跌倒、跌落,不能与“想法和观念”搭配,排除。D项,“推翻”,根本否定已有的说法、计划、决定等。第二空,根据后文“是谁扣动了科学危机的扳机”可知,设空处表达需要弄清楚,弄明白到底是谁扣动了扳机,A项“厘清”指梳理清楚,符合文意,保留;B项“分清”指分辨清楚,一般是分辨清楚两个主体,而文中并未提及多个对象,不符合文意,排除;D项“厘正”指订正,与文意不符,排除。
因此,答案为A。