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【思路】
文段首先指出家犬差异巨大，却有共同的祖先“灰狼”，接着通过转折词引出家犬起源“各地的家犬并不是从各地的灰狼演化而来”。然后通过“基因组DNA”和“系统发育树”两个方面的研究论证“各地的家犬是从东亚南部地区演化而来”，所以文段主旨为各地家犬都是从东亚南部地区演化而来。A项，文段强调的是起源地，非共同祖先“灰狼”，排除；B项，“都是从东亚南部地区演化而来”即“有着共同起源地”，符合文中主旨，保留；C项，“系统发育树”属于用来论证主旨的研究，非重点，排除；D项，“基因组DNA”也属于论证的研究，非重点，排除。
因此，答案为B。
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