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【思路】
牙齿和骨骼均属于“远古社会留下的物质遗骸”,可以对应文段第二段,属于第一种研究方法,对应A项。第二种研究方法主要探讨的是“对现代采集狩猎部落的研究”,第三种研究方法主要探讨的是“基于现代基因差异对比研究的新方法”,“牙齿和骨骼”均不属于这两个范畴,排除其余三项。
因此,答案为A。