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【思路】
本题可由第二空入手,根据转折关联词“但是”,及前文“有着共同的祖先”可知所填成语应该表达“不同”之意。
A项:“大相径庭”指相差很远,大不相同,符合文意。
B项:“毫无二致”指丝毫没有什么两样,指完全一样,与文意相悖,排除。
C项:“云泥之别”指相差像天空的云和地下的泥,比喻高低差别悬殊,文中只是表达鸟喙各种各样,并没有高低上下之别,与文意不符,排除。
D项:“异曲同工”指不同的曲调演得同样好,比喻做法不相同而效果一样好,与文意相悖排除。
验证第一空。根据后文“生物多样性的神奇”,A项“惊叹”指惊讶赞叹,符合文意。
因此,答案为A。